Du hast 2 Möglichkeiten: Entweder bei jedem angefassten Bauteil die Werte nach Energieeinsparverordnung einhalten, oder aber insgesamt die Werte des Referenzgebäudes + 40% einhalten.
Zweiteres wird schwierig, wenn man beispielsweise nur das Dach erneuern möchte, weil man dann sehr wahrscheinlich auch Heizung, Wände etc. mitmachen müsste, um die nötigen Werte, bezogen auf das ganze Haus, zu erreichen.
Da ihr aber ohnehin einen Rundumschlag plant, kommt euch die 140%-Regel entgegen, weil ihr darüber z.B. die (zu) schlechte Außenwand durch bessere Fenster, mehr Dämmstärke im Dach, oder eben einen geringeren Wärmebrückenzuschlag kompensieren könnt.
Das funktioniert wie bei einem KFW-Effizienzhaus.